Piégé sur une île tropicale à l'écart de toute civilisation. vous incarnez Jason Brody, un homme ordinaire à la recherche de ses amis capturés par Vaas, un chef de gang violent et au bord de la démence. Sans moyen pour communiquer avec l'extérieur, vous n'avez d'autre choix qu'apprendre à survivre, seul, sur une île dangereuse mais pleine de richesses. Explorez un territoire immense et infiltrez la société tribale pour tenter de récolter des informations sur vos amis auprès de chefs locaux tous plus perturbés les uns que les autres.